Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NOTCH4Q99466 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NOTCH4Q99466 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOTCH4Q99466 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms