Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT8L2Q96SF2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCT8L2Q96SF2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT8L2Q96SF2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCT8L2Q96SF2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms