Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL2Q96S94 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL2Q96S94 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL2Q96S94 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL2Q96S94 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms