Protein–RNA interactions for Protein: Q96S90

LYSMD1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD1Q96S90 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD1Q96S90 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD1Q96S90 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LYSMD1Q96S90 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYSMD1Q96S90 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms