Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KC1Q96S38 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KC1Q96S38 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KC1Q96S38 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KC1Q96S38 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms