Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PANX1Q96RD7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PANX1Q96RD7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms