Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HHIPQ96QV1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HHIPQ96QV1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HHIPQ96QV1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HHIPQ96QV1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms