Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NEDD4LQ96PU5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD4LQ96PU5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms