Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT5

SLC46A1, Proton-coupled folate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A1Q96NT5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC46A1Q96NT5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC46A1Q96NT5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC46A1Q96NT5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms