Protein–RNA interactions for Protein: Q96N23

CFAP54, Cilia- and flagella-associated protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 3,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP54Q96N23 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP54Q96N23 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP54Q96N23 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP54Q96N23 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP54Q96N23 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP54Q96N23 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP54Q96N23 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP54Q96N23 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP54Q96N23 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP54Q96N23 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP54Q96N23 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP54Q96N23 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP54Q96N23 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP54Q96N23 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms