Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00477Q96M19 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00477Q96M19 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00477Q96M19 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms