Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOLD1Q96LR9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APOLD1Q96LR9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms