Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPGRIP1Q96KN7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPGRIP1Q96KN7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPGRIP1Q96KN7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPGRIP1Q96KN7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPGRIP1Q96KN7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPGRIP1Q96KN7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPGRIP1Q96KN7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPGRIP1Q96KN7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPGRIP1Q96KN7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPGRIP1Q96KN7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPGRIP1Q96KN7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPGRIP1Q96KN7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPGRIP1Q96KN7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPGRIP1Q96KN7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPGRIP1Q96KN7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms