Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK5RAP3Q96JB5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK5RAP3Q96JB5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK5RAP3Q96JB5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms