Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRELD1Q96HD1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRELD1Q96HD1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRELD1Q96HD1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms