Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX11Q96FC9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DDX11Q96FC9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX11Q96FC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX11Q96FC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX11Q96FC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms