Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC97Q96F63 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC97Q96F63 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC97Q96F63 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC97Q96F63 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms