Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUS1Q96E22 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUS1Q96E22 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUS1Q96E22 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms