Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EME1Q96AY2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EME1Q96AY2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EME1Q96AY2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms