Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3Q969T4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2E3Q969T4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3Q969T4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms