Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP13Q92995 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP13Q92995 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP13Q92995 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP13Q92995 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP13Q92995 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP13Q92995 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP13Q92995 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP13Q92995 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP13Q92995 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP13Q92995 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP13Q92995 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP13Q92995 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP13Q92995 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP13Q92995 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP13Q92995 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP13Q92995 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP13Q92995 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP13Q92995 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP13Q92995 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP13Q92995 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP13Q92995 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP13Q92995 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP13Q92995 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP13Q92995 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP13Q92995 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP13Q92995 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP13Q92995 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP13Q92995 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP13Q92995 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP13Q92995 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP13Q92995 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP13Q92995 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP13Q92995 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP13Q92995 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP13Q92995 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP13Q92995 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP13Q92995 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP13Q92995 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP13Q92995 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP13Q92995 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP13Q92995 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP13Q92995 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP13Q92995 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP13Q92995 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP13Q92995 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP13Q92995 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP13Q92995 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP13Q92995 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP13Q92995 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP13Q92995 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP13Q92995 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP13Q92995 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP13Q92995 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP13Q92995 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP13Q92995 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP13Q92995 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP13Q92995 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP13Q92995 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP13Q92995 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP13Q92995 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP13Q92995 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP13Q92995 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP13Q92995 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP13Q92995 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP13Q92995 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP13Q92995 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP13Q92995 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP13Q92995 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP13Q92995 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP13Q92995 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP13Q92995 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP13Q92995 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP13Q92995 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP13Q92995 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP13Q92995 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP13Q92995 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP13Q92995 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP13Q92995 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP13Q92995 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP13Q92995 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP13Q92995 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP13Q92995 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP13Q92995 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP13Q92995 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP13Q92995 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP13Q92995 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP13Q92995 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP13Q92995 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP13Q92995 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP13Q92995 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP13Q92995 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP13Q92995 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP13Q92995 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP13Q92995 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP13Q92995 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP13Q92995 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP13Q92995 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP13Q92995 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP13Q92995 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms