Protein–RNA interactions for Protein: Q92930

RAB8B, Ras-related protein Rab-8B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8BQ92930 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB8BQ92930 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB8BQ92930 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms