Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NCSTNQ92542 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCSTNQ92542 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCSTNQ92542 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms