Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ATRIPQ8WXE1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRIPQ8WXE1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRIPQ8WXE1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms