Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ABCA10Q8WWZ4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ABCA10Q8WWZ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCA10Q8WWZ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCA10Q8WWZ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCA10Q8WWZ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
ABCA10Q8WWZ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCA10Q8WWZ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ABCA10Q8WWZ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
ABCA10Q8WWZ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ABCA10Q8WWZ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ABCA10Q8WWZ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ABCA10Q8WWZ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ABCA10Q8WWZ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ABCA10Q8WWZ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ABCA10Q8WWZ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ABCA10Q8WWZ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ABCA10Q8WWZ4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ABCA10Q8WWZ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ABCA10Q8WWZ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ABCA10Q8WWZ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ABCA10Q8WWZ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms