Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C2Q8WUA4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C2Q8WUA4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C2Q8WUA4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C2Q8WUA4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms