Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAA9

VANGL1, Vang-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL1Q8TAA9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VANGL1Q8TAA9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VANGL1Q8TAA9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VANGL1Q8TAA9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms