Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PATJQ8NI35 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATJQ8NI35 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATJQ8NI35 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms