Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP61Q8NHU2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP61Q8NHU2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP61Q8NHU2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms