Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET8

TRPV3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV3Q8NET8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPV3Q8NET8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPV3Q8NET8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPV3Q8NET8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms