Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
EHBP1Q8NDI1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EHBP1Q8NDI1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EHBP1Q8NDI1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.2 ms