Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND76

CCNY, Cyclin-Y, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYQ8ND76 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNYQ8ND76 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNYQ8ND76 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNYQ8ND76 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNYQ8ND76 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNYQ8ND76 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNYQ8ND76 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNYQ8ND76 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNYQ8ND76 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNYQ8ND76 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNYQ8ND76 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNYQ8ND76 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms