Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIBP2Q8ND30 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP2Q8ND30 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIBP2Q8ND30 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms