Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC150Q8NCX0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC150Q8NCX0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC150Q8NCX0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC150Q8NCX0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC150Q8NCX0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms