Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD1Q8NB12 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD1Q8NB12 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMYD1Q8NB12 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms