Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FSIP1Q8NA03 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FSIP1Q8NA03 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FSIP1Q8NA03 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms