Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L1

KRTCAP2, Keratinocyte-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTCAP2Q8N6L1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTCAP2Q8N6L1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTCAP2Q8N6L1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRTCAP2Q8N6L1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTCAP2Q8N6L1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTCAP2Q8N6L1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTCAP2Q8N6L1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTCAP2Q8N6L1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTCAP2Q8N6L1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTCAP2Q8N6L1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTCAP2Q8N6L1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTCAP2Q8N6L1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTCAP2Q8N6L1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTCAP2Q8N6L1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTCAP2Q8N6L1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms