Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC33Q8N5R6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC33Q8N5R6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC33Q8N5R6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms