Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHCHD4Q8N4Q1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHCHD4Q8N4Q1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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