Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA5B2Q8N398 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA5B2Q8N398 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA5B2Q8N398 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms