Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHACTR4Q8IZ21 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHACTR4Q8IZ21 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms