Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC22A9Q8IVM8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A9Q8IVM8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A9Q8IVM8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms