Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC50Q8IVM0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms