Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMB4Q86W47 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNMB4Q86W47 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms