Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms