Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KNDC1Q76NI1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KNDC1Q76NI1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
KNDC1Q76NI1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
KNDC1Q76NI1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KNDC1Q76NI1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KNDC1Q76NI1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KNDC1Q76NI1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KNDC1Q76NI1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms