Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYS1Q717R9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYS1Q717R9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYS1Q717R9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms