Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PREX2Q70Z35 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PREX2Q70Z35 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PREX2Q70Z35 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PREX2Q70Z35 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PREX2Q70Z35 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PREX2Q70Z35 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PREX2Q70Z35 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PREX2Q70Z35 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PREX2Q70Z35 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PREX2Q70Z35 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PREX2Q70Z35 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PREX2Q70Z35 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.2 ms