Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYDE1Q6ZW31 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYDE1Q6ZW31 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYDE1Q6ZW31 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYDE1Q6ZW31 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms