Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM47EQ6ZV65 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms